BLAST 模块

Sequence similarity search · 序列相似性检索

默认不在本机执行 BLAST：下方表单用于整理选项并打开 NCBI BLAST 网页；若已安装 BLAST+ 且在 instance/blast/db 建好索引库，可使用「本机 BLAST+」在同一页面运行。 库内当前约 262 个活跃物种；基因组 / 转录组 FASTA 可从 Genome Download 获取，基因列表见 Gene 模块。

English: BLAST jobs run on NCBI servers when you use the button below. For large batches or custom databases, install BLAST+ locally.

检索选项

选择后仅影响下方「推荐 NCBI 程序」提示；实际数据库请在 NCBI 页面中选择（如 nr、nt、refseq 等）。

查询序列类型

说明：通过 URL 传递序列时，浏览器与 NCBI 对长度有限制；超长序列请使用「复制序列」后在 NCBI 页面粘贴。 推荐程序：核苷酸 → blastn / Megablast

Diamond blastp（蛋白 vs 本库 · 类 InsectBase 3.0）

正在检测 Diamond…

自动合并：① instance/ncbi_refseq_genomes 下各物种 *_protein.faa.gz；② instance/diamond/supplemental_faa/ 中自放的蛋白 FASTA（基因导出等，见该目录 README）。输出库：instance/diamond/db/insectbase_refseq_proteins.dmnd。查询须为氨基酸（可与上方同一文本框粘贴蛋白序列）。须先点「重建 Diamond 库」再运行 blastp；重建可能数分钟，期间请勿重复点击以免锁冲突。

输出为 tab 分隔（-f 6）。无结果时为空或仅提示。

本机 BLAST+（可选）

正在检测本机 BLAST…

NCBI BLAST 快捷入口

Megablast / blastn blastp blastx tblastn tblastx

BLAST 帮助文档（NCBI）

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