Service
Emerging Alien Species 数据库提供的 API 接口与服务入口。
Service Catalog
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API Documentation
API endpoints grouped by module (Core / KEGG / GO / Heatmap / MaxEnt / Occurrences / biomod2).
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获取系统物种列表（按分类分组）。
GET/api/species/list
获取 KEGG 模块概览统计。
GET/api/ipathway/summary
获取 iPathway 可选物种列表及可用性。
GET/api/ipathway/organisms
获取 KEGG Pathway 列表。
GET/api/ipathway/kegg-pathways
按物种与通路检索 KEGG 基因。
GET/api/ipathway/search-genes
获取 GO 模块概览统计。
GET/api/go-annotation/summary
获取 GO Annotation 可选物种列表。
GET/api/go-annotation/organisms
获取 GO term 词表。
GET/api/go-annotation/terms
按物种与 GO term 检索基因。
GET/api/go-annotation/search-genes
Run Annotation Task
GO/KEGG
internal
提交 GO/KEGG 注释后台任务。
POST/api/annotation/task/run
Annotation Task Status
GO/KEGG
internal
查询注释任务执行状态。
GET/api/annotation/task/{task_id}
获取 Heatmap 模块概览信息。
GET/api/heatmap/summary
获取系统可用物种列表。
GET/api/heatmap/species
提交 Heatmap 任务（上传或系统数据）。
POST/api/heatmap/task/run
获取 MaxEnt 运行器版本信息。
GET/api/maxent/version
提交 MaxEnt 预测任务。
POST/api/maxent/predict
Occurrences List
Occurrence
internal
列出出现点（需 query：species_id 或 scientific_name，最多约 5000 条）。
GET/api/occurrences
Occurrence Create
Occurrence
internal
手工写入一条经纬度（JSON：species_id, latitude, longitude；可选 locality 等）。
POST/api/occurrences
Occurrence Delete
Occurrence
internal
软删除单条记录（status 置为 inactive）。
DELETE/api/occurrences/{occ_id}
Occurrences Import GBIF
Occurrence
internal
按物种 ID 从 GBIF 导入带坐标出现点（limit、country 可选）。
POST/api/occurrences/import-gbif
Occurrences Import GBIF Batch
Occurrence
internal
对活跃物种批量 GBIF（limit_per_species、max_species、skip_if_active_occurrences_ge、dry_run、delay_sec 等）。
POST/api/occurrences/import-gbif-batch
Occurrences Export CSV
Occurrence
internal
导出出现点为 CSV，返回服务端绝对路径（biomod2 / MaxEnt 的 occurrence_csv）。也可用 POST + JSON。
GET/api/occurrences/export-csv
探测本机 Rscript 与 R 包 biomod2、运行器版本。
GET/api/biomod2/version
biomod2 Raster hints
biomod2
internal
检测 data_root 下默认 WorldClim / 中国裁剪目录是否存在及 .tif 数量。
GET/api/biomod2/raster-hints
写入 payload.json 并调用 run_biomod2.R 单次建模。
POST/api/biomod2/run
biomod2 Run batch
biomod2
internal
按库内物种批量导出 CSV 并依次调用 R（可选 all_active_rows、GBIF 补点等）。
POST/api/biomod2/run-batch
biomod2 Recent outputs
biomod2
internal
列出 biomod2_runs 下最近成功的投影 GeoTIFF（limit、dedupe）。
GET/api/biomod2/recent-outputs
biomod2 Open output
biomod2
internal
在白名单目录内下载/预览输出文件（query: path, download）。
GET/api/biomod2/open-output
Data Download
Use the unified download entry and data export utilities.
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Help & Support
Support channels and related module navigation.
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出现点缺口、风险未评估清单、CITES 备注待补全（对应阶段性汇报下一步）。
红耳龟 / 收获蚁 / 豹纹守宫：查档案→看分布→判风险→识物种。
导出阶段性验收用汇总指标（物种数、出现点、biomod2、危害特征、预警等）。
业务数据默认在 D:\insectbase_data（或服务器 INSECTBASE_DATA_ROOT）。备份请整目录复制 instance/、media/；代码与 deploy/easbase.env 分开保存。上线用 deploy/start_gunicorn.sh / systemd easbase。
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